fix(boundary): 修复多库边界问题、版本管理及删除清理

多库检索与存储修复:
- RRF 融合去重改用 (collection, chunk_id) 复合键，修复同名文件结果被吞
- DocStore 存储路径加 collection 前缀，修复跨库同名切片数据覆盖
- search_multiple 去重改用复合键
- chunk_id 解析改用 rsplit 兼容下划线文件名

上传与版本管理修复:
- 同名文件上传改为覆盖模式，自动清理旧切片
- 修复首次上传不创建版本记录
- 修复覆盖上传版本号回退到 v1
- sync ADDED 分支改用动态版本号生成
- _generate_version_id 改为基于全部版本递增
- 废止/恢复操作同步 SQLite 版本记录
- mark_document_as_superseded 改为仅更新 SQLite

删除清理修复:
- 删除文档时同步清理 SQLite 版本记录和变更日志
- 删除向量库时同步清理该库所有版本记录
- cleanup 改为清理 SQLite 记录而非 ChromaDB

测试:
- test_version_management.py: 27 条版本管理单元测试
- test_edge_cases.py: 28 条边界用例测试
- test_upload_dedup.py: 5 条上传去重测试
- e2e_risk_test.py: 27 条端到端风险测试

文档:
- 新增风险边界问题修复注意事项.md（面向后端的对接文档）
- 新增向量库边界风险分析.md
- 更新多篇现有文档

test_files/parse_rag.py

@@ -0,0 +1,25 @@
+import json
+import re
+import sys
+
+sys.stdout.reconfigure(encoding='utf-8')
+
+with open(r'C:\Users\qq318\Desktop\rag-agent\test_files\rag_output.txt', 'r', encoding='utf-8') as f:
+    for line in f:
+        line = line.strip()
+        if line.startswith('data: ') and '"type": "finish"' in line:
+            data = json.loads(line[6:])
+            citations = data.get('citations', [])
+            print(f'Citation count: {len(citations)}')
+            for i, c in enumerate(citations):
+                coll = c.get('collection', '')
+                cid = c.get('chunk_id', '')
+                src = c.get('source', '')
+                preview = c.get('content', '')[:80]
+                print(f'  [{i+1}] collection={coll}, chunk_id={cid}, source={src}')
+                print(f'       content: {preview}...')
+            print()
+            answer = data.get('answer', '')
+            refs = re.findall(r'\[ref:([^\]]+)\]', answer)
+            print(f'Ref tags in answer: {refs}')
+            print(f'Answer preview: {answer[:200]}...')