fix(boundary): 修复多库边界问题、版本管理及删除清理

多库检索与存储修复:
- RRF 融合去重改用 (collection, chunk_id) 复合键，修复同名文件结果被吞
- DocStore 存储路径加 collection 前缀，修复跨库同名切片数据覆盖
- search_multiple 去重改用复合键
- chunk_id 解析改用 rsplit 兼容下划线文件名

上传与版本管理修复:
- 同名文件上传改为覆盖模式，自动清理旧切片
- 修复首次上传不创建版本记录
- 修复覆盖上传版本号回退到 v1
- sync ADDED 分支改用动态版本号生成
- _generate_version_id 改为基于全部版本递增
- 废止/恢复操作同步 SQLite 版本记录
- mark_document_as_superseded 改为仅更新 SQLite

删除清理修复:
- 删除文档时同步清理 SQLite 版本记录和变更日志
- 删除向量库时同步清理该库所有版本记录
- cleanup 改为清理 SQLite 记录而非 ChromaDB

测试:
- test_version_management.py: 27 条版本管理单元测试
- test_edge_cases.py: 28 条边界用例测试
- test_upload_dedup.py: 5 条上传去重测试
- e2e_risk_test.py: 27 条端到端风险测试

文档:
- 新增风险边界问题修复注意事项.md（面向后端的对接文档）
- 新增向量库边界风险分析.md
- 更新多篇现有文档

knowledge/collection.py

@@ -299,6 +299,29 @@ class CollectionMixin:
             except Exception as e:
                 logger.warning(f"清理哈希记录失败: {e}")
 
+            # 清理该向量库的 SQLite 版本记录和变更日志
+            try:
+                from data.db import get_connection
+                with get_connection("knowledge") as conn:
+                    cursor1 = conn.execute(
+                        "DELETE FROM document_versions WHERE collection = ?",
+                        (kb_name,)
+                    )
+                    cursor2 = conn.execute(
+                        "DELETE FROM version_change_logs WHERE collection = ?",
+                        (kb_name,)
+                    )
+                    conn.commit()
+                    ver_cleaned = cursor1.rowcount
+                    log_cleaned = cursor2.rowcount
+                    if ver_cleaned > 0 or log_cleaned > 0:
+                        logger.info(
+                            f"清理向量库版本记录: {kb_name}, "
+                            f"版本 {ver_cleaned} 条, 日志 {log_cleaned} 条"
+                        )
+            except Exception as e:
+                logger.warning(f"清理版本记录失败: {e}")
+
             if kb_name in self._metadata.get("collections", {}):
                 del self._metadata["collections"][kb_name]
             self._save_metadata()