fix(boundary): 修复多库边界问题、版本管理及删除清理

多库检索与存储修复:
- RRF 融合去重改用 (collection, chunk_id) 复合键，修复同名文件结果被吞
- DocStore 存储路径加 collection 前缀，修复跨库同名切片数据覆盖
- search_multiple 去重改用复合键
- chunk_id 解析改用 rsplit 兼容下划线文件名

上传与版本管理修复:
- 同名文件上传改为覆盖模式，自动清理旧切片
- 修复首次上传不创建版本记录
- 修复覆盖上传版本号回退到 v1
- sync ADDED 分支改用动态版本号生成
- _generate_version_id 改为基于全部版本递增
- 废止/恢复操作同步 SQLite 版本记录
- mark_document_as_superseded 改为仅更新 SQLite

删除清理修复:
- 删除文档时同步清理 SQLite 版本记录和变更日志
- 删除向量库时同步清理该库所有版本记录
- cleanup 改为清理 SQLite 记录而非 ChromaDB

测试:
- test_version_management.py: 27 条版本管理单元测试
- test_edge_cases.py: 28 条边界用例测试
- test_upload_dedup.py: 5 条上传去重测试
- e2e_risk_test.py: 27 条端到端风险测试

文档:
- 新增风险边界问题修复注意事项.md（面向后端的对接文档）
- 新增向量库边界风险分析.md
- 更新多篇现有文档

docs/数据归属与协作方案.md

@@ -2,36 +2,34 @@
 
 > **文档类型**: 架构设计
 > **创建日期**: 2026-04-13
-> **状态**: 已确认
+> **状态**: 已确认（数据清单更新于 2026-06）
 > **目标**: 梳理数据存储归属、明确前后端组与 RAG 组的职责边界
 
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 ## 一、数据存储清单
 
-### 1.1 当前系统中的所有数据库
+### 1.1 当前系统中的所有数据库（4 个 SQLite 文件，按环境子目录分离）
 
-| 数据库文件 | 存储内容 | 表数量 |
-|-----------|----------|--------|
-| `data/sessions.db` | 会话管理 | 2 表 |
-| `data/exam_local.db` | 出题批卷 | 5 表 |
-| `data/feedback.db` | 问答质量闭环 | 4 表 |
-| `data/outline_cache.db` | 纲要缓存 | 3 表 |
-| `data/sync_data.db` | 同步服务 | 5 表 |
-| `data/exam_analysis.db` | 题库分析 | 7 表 |
-| `knowledge/vector_store/chroma/` | 向量数据库 | 9 集合 |
+| 数据库文件 | 环境 | 存储内容 |
+|-----------|------|---------|
+| `data/prod/knowledge.db` | 生产 | 知识库管理（向量元数据、文档索引等） |
+| `data/prod/feedback.db` | 生产 | 问答质量闭环 |
+| `data/dev/session.db` | 开发 | 会话管理 |
+| `data/dev/exam.db` | 开发 | 出题批卷 |
+
+> **注**：向量数据存储在 `knowledge/vector_store/chroma/` 目录（ChromaDB），不计入 SQLite 文件。
+> `outline_cache.db`、`sync_data.db`、`exam_analysis.db` 已合并或移除。
 
 ### 1.2 涉及用户信息的数据
 
 | 数据库 | 表 | 用户字段 | 敏感程度 |
 |--------|-----|----------|----------|
-| sessions.db | sessions | user_id | 低（仅ID） |
-| sessions.db | messages | 通过session关联 | 低 |
-| feedback.db | feedbacks | user_id | 低 |
-| sync_data.db | subscriptions | user_id | 低 |
-| sync_data.db | notifications | user_id | 低 |
-| exam_local.db | student_answers | student_id | 低 |
-| exam_local.db | grade_reports | student_id | 低 |
+| `data/dev/session.db` | sessions | user_id | 低（仅ID） |
+| `data/dev/session.db` | messages | 通过session关联 | 低 |
+| `data/prod/feedback.db` | feedbacks | user_id | 低 |
+| `data/dev/exam.db` | student_answers | student_id | 低 |
+| `data/dev/exam.db` | grade_reports | student_id | 低 |
 
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@@ -54,16 +52,15 @@
 
 | 数据类型 | 说明 |
 |----------|------|
-| 向量数据库 | 所有知识库向量 |
+| 向量数据库 | 所有知识库向量（ChromaDB） |
 | 文档内容 | PDF/Word/Excel 原始文件 |
-| 题目与试卷数据 | 出题相关 |
-| 批阅报告 | 考试批卷结果 |
-| 知识点与关联关系 | 题库分析 |
-| 文档变更追踪 | 同步服务 |
-| 会话历史 | 对话记录 ✅ |
-| 纲要与缓存 | 文档结构化数据 |
+| 知识库元数据 | 文档索引、向量关联（`knowledge.db`） |
+| 题目与试卷数据 | 出题相关（`exam.db`） |
+| 批阅报告 | 考试批卷结果（`exam.db`） |
+| 会话历史 | 对话记录（`session.db`） |
+| 问答反馈 | 质量闭环数据（`feedback.db`） |
 
-**存储**：本地 SQLite + ChromaDB
+**存储**：本地 SQLite（按 `data/prod/`、`data/dev/` 环境分离） + ChromaDB
 
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@@ -102,6 +99,10 @@
                                         ┌─────────────┐
                                         │  RAG 数据库  │
                                         │             │
+                                        │ • knowledge.db│
+                                        │ • feedback.db │
+                                        │ • session.db  │
+                                        │ • exam.db     │
                                         │ 存储 user_id │
                                         │ 不存用户详情 │
                                         └─────────────┘
@@ -156,7 +157,7 @@ GET /api/users/{user_id}
 |--------|------|------|
 | 学生答卷存储 | `exam_pkg/manager.py` | 改为只存储 student_id，不存 student_name |
 | 批阅报告生成 | `exam_pkg/manager.py` | 生成报告时调用前后端接口获取姓名 |
-| 用户信息获取 | `services/user_info.py`（新建） | 封装调用前后端接口的逻辑 |
+| 用户信息获取 | `services/user_info.py`（待创建） | 封装调用前后端接口的逻辑，当前尚未实现 |
 
 ---
 
@@ -171,9 +172,10 @@ GET /api/users/{user_id}
 │  ✓ 组织架构数据                         │  ✓ 题目试卷管理                  │
 │  ✓ 业务主数据（学生/课程等）             │  ✓ 批阅报告（仅存 student_id）   │
 │  ✓ 网关配置                             │  ✓ 反馈与质量分析                │
-│  ✓ 提供用户信息查询 API                 │  ✓ 文档变更追踪                  │
+│  ✓ 提供用户信息查询 API                 │  ✓ 知识库元数据（knowledge.db）   │
 ├─────────────────────────────────────────┴─────────────────────────────────┤
 │  数据关联：通过 user_id / student_id                                      │
 │  RAG 系统调用前后端 API 获取用户详情                                       │
+│  数据库按环境分离：data/prod/（knowledge.db, feedback.db）data/dev/（session.db, exam.db）│
 └─────────────────────────────────────────────────────────────────────────┘
 ```